Игроки Foldit разработали решение, которое может стать основой лечения ВИЧ
Игроки онлайн игры Foldit смогли выполнить задачку, над решением которой многие годы бились многие ученые. Они раскрыли структуру протеинов вируса M-PMV (Mason-Pfizer monkey virus), поражающего обезьян. M-PMV является ретровирусом, как и ВИЧ (вирус иммунодефицита человека), он вызывает СПИД (синдром приобретённого иммунодефицита) у обезьян. В итоге раскрытия структуры вируса M-PMV ученые уповают создать лечущее средство, способное излечивать ВИЧ.
Игра Foldit представляет собой сборник логических головоломок по комбинированию всеохватывающих белковых структур, представленных в виде приятных трехмерных моделей. Головоломки временами обновляются на базе данных о реальных белках. Сделанные игроками структуры потом анализируются с целью определения нужных для науки композиций протеиновых структур. При всем этом отмечается, что игра понятна не только лишь для профессионалов в сфере биохимии, да и для всех желающих. В ее простоте и кроется залог фуррора, потому что неспециалисты могут создавать разные композиции протеиновых структур, на которые не направят внимания спецы в этой сфере. По заверениям разработчиков, многим игрокам удается достигнуть значимых фурроров в разработке протеинов, в неких случаях эти успехи даже превосходят характеристики компьютерных систем моделирования белков на базе перебора огромного количества вероятных композиций. Невзирая на то, что человек не способен обрабатывать данные со скоростью производительных компьютерных систем, интуиция иногда позволяет отыскать наилучшее решение существенно резвее.
Отмечается, что ученые из Института Вашингтона (University of Washington) при содействии игроков Foldit смоделировали кристаллическую структуру ретровирусной протеазы (фермент, который расщепляет пептидную связь меж аминокислотами в белках) вируса M-PMV. Ретровирусные протеазы играют важную роль в процессах роста и размножения вируса. Заблокируя их активность, можно предупредить развитие вируса, что и станет основой лекарства против ВИЧ. Но неувязка состоит в том, что ученым ранее была неведома структура молекул протеазы. Протеины состоят из длинноватых цепочек аминокислот — молекул, состоящих из углерода, водорода, кислорода и азота. Аминокислоты могут быть объединены в разные всеохватывающие структуры, объединяясь под разными углами. Такое обилие форм и порождает задачи четкого определения структур протеинов. Помощь игроков Foldit заключалась конкретно в нахождении структуры вируса M-PMV.